Phẫu thuật Lasik, cũng như bất kì phẫu thuật nào khác,  có thể có nguy cơ nhiễm trùng. Tuy nhiên, chùm tia laser không thể truyền bệnh nhiễm trùng. Ngoài ra, cũng như ở các phẫu thuật khác, để đề phòng nhiễm trùng, tại Bệnh viện Mắt Quốc tế DND, quy trình khám, phẫu thuật được đảm bảo  vô trùng tuyệt đối, vật liệu tiêu hao và dao mổ chỉ dùng một lần và của các hãng nổi tiếng thế giới (Alcon, Nidek, Carl zeiss…). Sau phẫu thuật, người bệnh sẽ được cấp các thuốc tra mắt để phòng chống nhiễm trùng sau mổ.